Protein–RNA interactions for Protein: P40318

SSM4, ERAD-associated E3 ubiquitin-protein ligase DOA10, yeastyeast

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Length 1,319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSM4P40318 YAT1YAR035W 2064 nt13.38□□□□□ -0.27
SSM4P40318 CYT2YKL087C 675 nt13.38□□□□□ -0.27
SSM4P40318 PAU15YIR041W 375 nt13.36□□□□□ -0.27
SSM4P40318 YJL118WYJL118W 660 nt13.36□□□□□ -0.27
SSM4P40318 FLR1YBR008C 1647 nt13.35□□□□□ -0.27
SSM4P40318 YEL008WYEL008W 381 nt13.35□□□□□ -0.27
SSM4P40318 ZRT3YKL175W 1512 nt13.33□□□□□ -0.28
SSM4P40318 URA6YKL024C 615 nt13.33□□□□□ -0.28
SSM4P40318 SAM2YDR502C 1155 nt13.32□□□□□ -0.28
SSM4P40318 GAL3YDR009W 1563 nt13.31□□□□□ -0.28
SSM4P40318 PHO23YNL097C 993 nt13.29□□□□□ -0.28
SSM4P40318 MSC1YML128C 1542 nt13.28□□□□□ -0.28
SSM4P40318 LSB5YCL034W 1065 nt13.28□□□□□ -0.28
SSM4P40318 NUC1YJL208C 990 nt13.27□□□□□ -0.29
SSM4P40318 FUB1YCR076C 753 nt13.25□□□□□ -0.29
SSM4P40318 SNZ1YMR096W 894 nt13.25□□□□□ -0.29
SSM4P40318 DLD2YDL178W 1593 nt13.23□□□□□ -0.29
SSM4P40318 FMS1YMR020W 1527 nt13.23□□□□□ -0.29
SSM4P40318 TPS1YBR126C 1488 nt13.23□□□□□ -0.29
SSM4P40318 RPT5YOR117W 1305 nt13.22□□□□□ -0.29
SSM4P40318 CPD1YGR247W 720 nt13.22□□□□□ -0.29
SSM4P40318 PET8YNL003C 855 nt13.22□□□□□ -0.29
SSM4P40318 RSC8YFR037C 1674 nt13.22□□□□□ -0.29
SSM4P40318 SEC61YLR378C 1443 nt13.21□□□□□ -0.3
SSM4P40318 YER188WYER188W 720 nt13.2□□□□□ -0.3
SSM4P40318 SPP2YOR148C 558 nt13.19□□□□□ -0.3
SSM4P40318 YPS3YLR121C 1527 nt13.19□□□□□ -0.3
SSM4P40318 RAS2YNL098C 969 nt13.17□□□□□ -0.3
SSM4P40318 HEM13YDR044W 987 nt13.16□□□□□ -0.3
SSM4P40318 UME6YDR207C 2511 nt13.16□□□□□ -0.3
SSM4P40318 CCT5YJR064W 1689 nt13.16□□□□□ -0.3
SSM4P40318 DDI1YER143W 1287 nt13.13□□□□□ -0.31
SSM4P40318 CWC15YDR163W 528 nt13.13□□□□□ -0.31
SSM4P40318 RPM1RPM1 483 nt13.13□□□□□ -0.31
SSM4P40318 EAF3YPR023C 1206 nt13.13□□□□□ -0.31
SSM4P40318 TAT2YOL020W 1779 nt13.12□□□□□ -0.31
SSM4P40318 ACH1YBL015W 1581 nt13.12□□□□□ -0.31
SSM4P40318 OXA1YER154W 1209 nt13.12□□□□□ -0.31
SSM4P40318 OYE2YHR179W 1203 nt13.12□□□□□ -0.31
SSM4P40318 RPC82YPR190C 1965 nt13.1□□□□□ -0.31
SSM4P40318 RDN25-1RDN25-1 3396 nt13.1□□□□□ -0.31
SSM4P40318 RDN25-2RDN25-2 3396 nt13.1□□□□□ -0.31
SSM4P40318 THI72YOR192C 1800 nt13.09□□□□□ -0.31
SSM4P40318 YDR455CYDR455C 309 nt13.09□□□□□ -0.31
SSM4P40318 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt13.07□□□□□ -0.32
SSM4P40318 SOL2YCR073W-A 948 nt13.05□□□□□ -0.32
SSM4P40318 LSM5YER146W 282 nt13.05□□□□□ -0.32
SSM4P40318 ESS1YJR017C 513 nt13.05□□□□□ -0.32
SSM4P40318 OSH7YHR001W 1314 nt13.05□□□□□ -0.32
SSM4P40318 PAU5YFL020C 369 nt13.04□□□□□ -0.32
SSM4P40318 RIB7YBR153W 735 nt13.04□□□□□ -0.32
SSM4P40318 PGC1YPL206C 966 nt13.03□□□□□ -0.32
SSM4P40318 YOR325WYOR325W 474 nt13.02□□□□□ -0.33
SSM4P40318 TMA23YMR269W 636 nt13.01□□□□□ -0.33
SSM4P40318 YPR126CYPR126C 309 nt13.01□□□□□ -0.33
SSM4P40318 INA1YLR413W 2028 nt12.97□□□□□ -0.33
SSM4P40318 DAK2YFL053W 1776 nt12.96□□□□□ -0.33
SSM4P40318 CTI6YPL181W 1521 nt12.94□□□□□ -0.34
SSM4P40318 YMR262WYMR262W 942 nt12.93□□□□□ -0.34
SSM4P40318 APS2YJR058C 444 nt12.92□□□□□ -0.34
SSM4P40318 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt12.91□□□□□ -0.34
SSM4P40318 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt12.9□□□□□ -0.34
SSM4P40318 IMO32YGR031W 1029 nt12.87□□□□□ -0.35
SSM4P40318 TAF13YML098W 504 nt12.87□□□□□ -0.35
SSM4P40318 ERG13YML126C 1476 nt12.86□□□□□ -0.35
SSM4P40318 YBR232CYBR232C 360 nt12.85□□□□□ -0.35
SSM4P40318 CCT2YIL142W 1584 nt12.85□□□□□ -0.35
SSM4P40318 VPS62YGR141W 1404 nt12.84□□□□□ -0.35
SSM4P40318 AIM1YAL046C 357 nt12.83□□□□□ -0.36
SSM4P40318 SEN2YLR105C 1134 nt12.82□□□□□ -0.36
SSM4P40318 YNL024CYNL024C 741 nt12.81□□□□□ -0.36
SSM4P40318 MHF1YOL086W-A 273 nt12.81□□□□□ -0.36
SSM4P40318 LSB6YJL100W 1824 nt12.8□□□□□ -0.36
SSM4P40318 ASP3-1YLR155C 1089 nt12.8□□□□□ -0.36
SSM4P40318 ASP3-2YLR157C 1089 nt12.8□□□□□ -0.36
SSM4P40318 ASP3-3YLR158C 1089 nt12.8□□□□□ -0.36
SSM4P40318 ASP3-4YLR160C 1089 nt12.8□□□□□ -0.36
SSM4P40318 ADE8YDR408C 645 nt12.79□□□□□ -0.36
SSM4P40318 NIF3YGL221C 867 nt12.79□□□□□ -0.36
SSM4P40318 POT1YIL160C 1254 nt12.78□□□□□ -0.36
SSM4P40318 SPT20YOL148C 1815 nt12.77□□□□□ -0.36
SSM4P40318 ILV3YJR016C 1758 nt12.76□□□□□ -0.37
SSM4P40318 BET2YPR176C 978 nt12.76□□□□□ -0.37
SSM4P40318 IML3YBR107C 738 nt12.76□□□□□ -0.37
SSM4P40318 OPI10YOL032W 741 nt12.75□□□□□ -0.37
SSM4P40318 YDL086WYDL086W 822 nt12.74□□□□□ -0.37
SSM4P40318 SPS100YHR139C 981 nt12.74□□□□□ -0.37
SSM4P40318 STP3YLR375W 1032 nt12.74□□□□□ -0.37
SSM4P40318 SAC7YDR389W 1965 nt12.73□□□□□ -0.37
SSM4P40318 TUB4YLR212C 1422 nt12.73□□□□□ -0.37
SSM4P40318 YJL064WYJL064W 396 nt12.72□□□□□ -0.37
SSM4P40318 CDD1YLR245C 429 nt12.7□□□□□ -0.38
SSM4P40318 PUP1YOR157C 786 nt12.7□□□□□ -0.38
SSM4P40318 CMP2YML057W 1815 nt12.69□□□□□ -0.38
SSM4P40318 NAS2YIL007C 663 nt12.69□□□□□ -0.38
SSM4P40318 OPI3YJR073C 621 nt12.69□□□□□ -0.38
SSM4P40318 RRT8YOL048C 1029 nt12.68□□□□□ -0.38
SSM4P40318 MUP1YGR055W 1725 nt12.67□□□□□ -0.38
SSM4P40318 ARO8YGL202W 1503 nt12.66□□□□□ -0.38
SSM4P40318 GSF2YML048W 1212 nt12.65□□□□□ -0.38
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