Protein–RNA interactions for Protein: O60832

DKC1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKC1O60832 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC6.8□□□□□ -1.321e-20■■■■■ 92.4
DKC1O60832 IARS-211ENST00000490438 887 ntTSL 215.66■□□□□ 0.11e-323■■■■■ 92.4
DKC1O60832 IARS-203ENST00000395554 1103 ntTSL 515.08■□□□□ 01e-323■■■■■ 92.4
DKC1O60832 IARS-205ENST00000443024 4341 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.111e-323■■■■■ 92.4
DKC1O60832 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.151e-323■■■■■ 92.4
DKC1O60832 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.221e-323■■■■■ 92.4
DKC1O60832 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.311e-323■■■■■ 92.4
DKC1O60832 IARS-204ENST00000430417 414 ntTSL 36.18□□□□□ -1.421e-323■■■■■ 92.4
DKC1O60832 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC4.15□□□□□ -1.751e-323■■■■■ 92.4
DKC1O60832 EIF4A2-201ENST00000323963 1919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.632e-7■■■■■ 92.4
DKC1O60832 EIF4A2-203ENST00000426808 1751 ntTSL 1 (best)8.21□□□□□ -1.12e-7■■■■■ 92.4
DKC1O60832 EIF4A2-207ENST00000443963 1729 ntTSL 1 (best)7.63□□□□□ -1.192e-7■■■■■ 92.4
DKC1O60832 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.242e-7■■■■■ 92.4
DKC1O60832 EIF4A2-204ENST00000429589 1005 ntTSL 56.79□□□□□ -1.322e-7■■■■■ 92.4
DKC1O60832 EIF4A2-202ENST00000425053 1977 ntTSL 56.12□□□□□ -1.432e-7■■■■■ 92.4
DKC1O60832 EIF4A2-219ENST00000485101 5327 ntTSL 54.49□□□□□ -1.692e-7■■■■■ 92.4
DKC1O60832 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.477e-60■■■■■ 92.3
DKC1O60832 SERPINA11-201ENST00000334708 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.091e-20■■■■■ 92.3
DKC1O60832 TBL1X-208ENST00000452824 387 ntTSL 512.87□□□□□ -0.357e-7■■■■■ 91.5
DKC1O60832 IGF2BP1-203ENST00000499130 568 ntTSL 313.88□□□□□ -0.194e-20■■■■■ 90.1
DKC1O60832 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.33e-39■■■■■ 90.1
DKC1O60832 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.431e-6■■■■■ 89.9
DKC1O60832 MGAT5-201ENST00000281923 8144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.836e-21■■■■■ 89.8
DKC1O60832 TBL1X-205ENST00000422314 496 ntTSL 226.81■■□□□ 1.887e-7■■■■■ 89.1
DKC1O60832 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.657e-7■■■■■ 89.1
DKC1O60832 TBL1X-202ENST00000380961 4674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.167e-7■■■■■ 89.1
DKC1O60832 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.257e-7■■■■■ 89.1
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DKC1O60832 TBL1X-204ENST00000415293 565 ntTSL 57.7□□□□□ -1.187e-7■■■■■ 89.1
DKC1O60832 TBL1X-207ENST00000441088 520 ntTSL 37.7□□□□□ -1.187e-7■■■■■ 89.1
DKC1O60832 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.612e-8■■■■■ 89.1
DKC1O60832 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.512e-26■■■■■ 87.9
DKC1O60832 CDK8-205ENST00000536792 3032 ntTSL 1 (best)17.04■□□□□ 0.322e-26■■■■■ 87.9
DKC1O60832 SLC13A3-203ENST00000372121 848 ntTSL 518.17■□□□□ 0.52e-56■■■■■ 87.3
DKC1O60832 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.152e-56■■■■■ 87.3
DKC1O60832 NRSN2-204ENST00000492242 846 ntTSL 223.61■■□□□ 1.374e-21■■■■■ 86.9
DKC1O60832 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.754e-21■■■■■ 86.9
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DKC1O60832 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.333e-11■■■■■ 86.3
DKC1O60832 FARSA-208ENST00000588965 1831 ntTSL 521.96■■□□□ 1.113e-11■■■■■ 86.3
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DKC1O60832 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.93e-11■■■■■ 86.3
DKC1O60832 FARSA-205ENST00000587488 514 ntTSL 315.59■□□□□ 0.093e-11■■■■■ 86.3
DKC1O60832 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.174e-22■■■■■ 86.3
DKC1O60832 THAP9-AS1-202ENST00000504520 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.351e-60■■■■■ 85.4
DKC1O60832 THAP9-AS1-208ENST00000508772 566 ntTSL 411.14□□□□□ -0.631e-60■■■■■ 85.4
DKC1O60832 SEC31A-218ENST00000506495 541 ntTSL 411.14□□□□□ -0.631e-60■■■■■ 85.4
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DKC1O60832 THAP9-AS1-204ENST00000504792 2577 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.831e-60■■■■■ 85.4
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DKC1O60832 SEC31A-211ENST00000503210 553 ntTSL 47.96□□□□□ -1.141e-60■■■■■ 85.4
DKC1O60832 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.471e-60■■■■■ 85.4
DKC1O60832 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.971e-323■■■■■ 85
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DKC1O60832 MC1R-201ENST00000539976 2464 ntTSL 514.38□□□□□ -0.113e-7■■■■■ 84.3
DKC1O60832 PHB2-208ENST00000543465 1518 ntTSL 525.12■■□□□ 1.611e-323■■■■■ 84.1
DKC1O60832 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.281e-323■■■■■ 84.1
DKC1O60832 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.221e-323■■■■■ 84.1
DKC1O60832 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.981e-323■■■■■ 84.1
DKC1O60832 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.961e-323■■■■■ 84.1
DKC1O60832 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.821e-323■■■■■ 84.1
DKC1O60832 PHB2-205ENST00000537646 874 ntTSL 517.07■□□□□ 0.321e-323■■■■■ 84.1
DKC1O60832 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.74■□□□□ 0.111e-323■■■■■ 84.1
DKC1O60832 PHB2-212ENST00000545555 309 ntTSL 510.93□□□□□ -0.661e-323■■■■■ 84.1
DKC1O60832 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 83.9
DKC1O60832 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.121e-6■■■■■ 83.9
DKC1O60832 RNA5-8SP6-201ENST00000515896 152 ntBASIC11.68□□□□□ -0.541e-18■■■■■ 83.7
DKC1O60832 VAV2-205ENST00000486113 523 ntTSL 214.3□□□□□ -0.121e-7■■■■■ 83.4
DKC1O60832 CCT6A-205ENST00000466572 686 ntTSL 213.7□□□□□ -0.222e-11■■■■■ 83.1
DKC1O60832 CCT6A-207ENST00000492618 692 ntTSL 311.73□□□□□ -0.532e-11■■■■■ 83.1
DKC1O60832 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.54e-7■■■■■ 83
DKC1O60832 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.792e-7■■■■■ 82.6
DKC1O60832 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.722e-7■■■■■ 82.6
DKC1O60832 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.72e-7■■■■■ 82.6
DKC1O60832 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.612e-7■■■■■ 82.6
DKC1O60832 OTUD5-205ENST00000455452 2077 ntTSL 522.91■■□□□ 1.262e-7■■■■■ 82.6
DKC1O60832 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.672e-7■■■■■ 82.6
DKC1O60832 OTUD5-207ENST00000484499 924 ntTSL 510.65□□□□□ -0.72e-7■■■■■ 82.6
DKC1O60832 EIF4A2-223ENST00000494445 629 ntTSL 29.99□□□□□ -0.811e-323■■■■■ 82.3
DKC1O60832 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.583e-18■■■■■ 81.5
DKC1O60832 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.373e-18■■■■■ 81.5
DKC1O60832 EPB41L4A-AS1-202ENST00000427306 1367 ntTSL 226.54■■□□□ 1.841e-323■■■■■ 81.5
DKC1O60832 EPB41L4A-AS1-203ENST00000442823 578 ntTSL 219.54■□□□□ 0.721e-323■■■■■ 81.5
DKC1O60832 EPB41L4A-AS1-204ENST00000508590 292 ntTSL 317.89■□□□□ 0.451e-323■■■■■ 81.5
DKC1O60832 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.241e-323■■■■■ 81.5
DKC1O60832 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.591e-323■■■■■ 81.5
DKC1O60832 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.347e-7■■■■■ 81.4
DKC1O60832 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.317e-7■■■■■ 81.4
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