Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.43■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC34.41■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.37■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC34.36■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms