Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEFLP07196 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEFLP07196 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEFLP07196 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEFLP07196 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEFLP07196 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEFLP07196 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEFLP07196 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEFLP07196 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NEFLP07196 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEFLP07196 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEFLP07196 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEFLP07196 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEFLP07196 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEFLP07196 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEFLP07196 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEFLP07196 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEFLP07196 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEFLP07196 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEFLP07196 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEFLP07196 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEFLP07196 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEFLP07196 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEFLP07196 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEFLP07196 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEFLP07196 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEFLP07196 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEFLP07196 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEFLP07196 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEFLP07196 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NEFLP07196 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NEFLP07196 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NEFLP07196 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NEFLP07196 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NEFLP07196 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEFLP07196 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEFLP07196 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEFLP07196 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEFLP07196 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NEFLP07196 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEFLP07196 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEFLP07196 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEFLP07196 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEFLP07196 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEFLP07196 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEFLP07196 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEFLP07196 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEFLP07196 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEFLP07196 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEFLP07196 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEFLP07196 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEFLP07196 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEFLP07196 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEFLP07196 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEFLP07196 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEFLP07196 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEFLP07196 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEFLP07196 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEFLP07196 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEFLP07196 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEFLP07196 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEFLP07196 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEFLP07196 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEFLP07196 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEFLP07196 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEFLP07196 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEFLP07196 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEFLP07196 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEFLP07196 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEFLP07196 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEFLP07196 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEFLP07196 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEFLP07196 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEFLP07196 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEFLP07196 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEFLP07196 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEFLP07196 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEFLP07196 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEFLP07196 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEFLP07196 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEFLP07196 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEFLP07196 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEFLP07196 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEFLP07196 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NEFLP07196 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEFLP07196 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEFLP07196 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEFLP07196 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEFLP07196 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEFLP07196 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEFLP07196 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEFLP07196 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEFLP07196 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NEFLP07196 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEFLP07196 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEFLP07196 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NEFLP07196 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEFLP07196 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEFLP07196 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEFLP07196 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.9 ms