Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMCO3A2RU48 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMCO3A2RU48 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMCO3A2RU48 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMCO3A2RU48 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMCO3A2RU48 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMCO3A2RU48 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMCO3A2RU48 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMCO3A2RU48 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMCO3A2RU48 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMCO3A2RU48 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMCO3A2RU48 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMCO3A2RU48 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SMCO3A2RU48 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMCO3A2RU48 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMCO3A2RU48 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMCO3A2RU48 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMCO3A2RU48 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMCO3A2RU48 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMCO3A2RU48 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMCO3A2RU48 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMCO3A2RU48 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMCO3A2RU48 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMCO3A2RU48 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SMCO3A2RU48 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMCO3A2RU48 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMCO3A2RU48 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMCO3A2RU48 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMCO3A2RU48 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMCO3A2RU48 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMCO3A2RU48 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMCO3A2RU48 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMCO3A2RU48 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMCO3A2RU48 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms