Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM106CQ9BVX2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM106CQ9BVX2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms