Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ODF4Q2M2E3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF4Q2M2E3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104 ms