Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXT1Q16394 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
EXT1Q16394 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXT1Q16394 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
EXT1Q16394 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXT1Q16394 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXT1Q16394 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXT1Q16394 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXT1Q16394 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXT1Q16394 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXT1Q16394 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXT1Q16394 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXT1Q16394 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXT1Q16394 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXT1Q16394 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
EXT1Q16394 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
EXT1Q16394 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXT1Q16394 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXT1Q16394 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXT1Q16394 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXT1Q16394 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXT1Q16394 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXT1Q16394 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXT1Q16394 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
EXT1Q16394 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXT1Q16394 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXT1Q16394 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
EXT1Q16394 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXT1Q16394 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXT1Q16394 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXT1Q16394 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXT1Q16394 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXT1Q16394 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
EXT1Q16394 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EXT1Q16394 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
EXT1Q16394 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXT1Q16394 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXT1Q16394 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXT1Q16394 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXT1Q16394 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXT1Q16394 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXT1Q16394 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXT1Q16394 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXT1Q16394 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXT1Q16394 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXT1Q16394 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXT1Q16394 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXT1Q16394 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
EXT1Q16394 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXT1Q16394 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXT1Q16394 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXT1Q16394 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXT1Q16394 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXT1Q16394 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXT1Q16394 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXT1Q16394 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EXT1Q16394 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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EXT1Q16394 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXT1Q16394 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXT1Q16394 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXT1Q16394 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXT1Q16394 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXT1Q16394 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXT1Q16394 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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EXT1Q16394 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXT1Q16394 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXT1Q16394 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXT1Q16394 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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EXT1Q16394 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXT1Q16394 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXT1Q16394 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXT1Q16394 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXT1Q16394 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXT1Q16394 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXT1Q16394 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXT1Q16394 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXT1Q16394 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
EXT1Q16394 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
EXT1Q16394 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXT1Q16394 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXT1Q16394 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXT1Q16394 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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