Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

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Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
EEA1Q15075 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
EEA1Q15075 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC34.69■■■■□ 3.14
EEA1Q15075 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
EEA1Q15075 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC34.69■■■■□ 3.14
EEA1Q15075 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
EEA1Q15075 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
EEA1Q15075 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
EEA1Q15075 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
EEA1Q15075 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
EEA1Q15075 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
EEA1Q15075 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
EEA1Q15075 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
EEA1Q15075 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
EEA1Q15075 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
EEA1Q15075 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
EEA1Q15075 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
EEA1Q15075 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
EEA1Q15075 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
EEA1Q15075 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
EEA1Q15075 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
EEA1Q15075 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
EEA1Q15075 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
EEA1Q15075 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
EEA1Q15075 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
EEA1Q15075 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
EEA1Q15075 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
EEA1Q15075 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
EEA1Q15075 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
EEA1Q15075 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
EEA1Q15075 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
EEA1Q15075 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
EEA1Q15075 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
EEA1Q15075 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
EEA1Q15075 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
EEA1Q15075 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
EEA1Q15075 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
EEA1Q15075 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
EEA1Q15075 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
EEA1Q15075 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
EEA1Q15075 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
EEA1Q15075 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
EEA1Q15075 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
EEA1Q15075 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
EEA1Q15075 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
EEA1Q15075 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.14
EEA1Q15075 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
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