Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COL19A1Q14993 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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