Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC63Q05C16 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms