Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PHKA1P46020 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PHKA1P46020 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PHKA1P46020 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHKA1P46020 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHKA1P46020 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHKA1P46020 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHKA1P46020 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHKA1P46020 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHKA1P46020 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHKA1P46020 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHKA1P46020 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHKA1P46020 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHKA1P46020 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHKA1P46020 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHKA1P46020 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHKA1P46020 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHKA1P46020 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHKA1P46020 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHKA1P46020 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHKA1P46020 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHKA1P46020 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHKA1P46020 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHKA1P46020 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHKA1P46020 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms