Protein–RNA interactions for Protein: P40317

SOK1, Protein SOK1, yeastyeast

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SOK1P40317 YLR256W-AYLR256W-A 1323 nt2.37□□□□□ -2.03
SOK1P40317 YML040WYML040W 1323 nt2.37□□□□□ -2.03
SOK1P40317 YML045W-AYML045W-A 1323 nt2.37□□□□□ -2.03
SOK1P40317 YMR051CYMR051C 1323 nt2.37□□□□□ -2.03
SOK1P40317 YNL054W-AYNL054W-A 1323 nt2.37□□□□□ -2.03
SOK1P40317 YOL103W-AYOL103W-A 1323 nt2.37□□□□□ -2.03
SOK1P40317 YPL257W-AYPL257W-A 1323 nt2.37□□□□□ -2.03
SOK1P40317 YPR137C-AYPR137C-A 1323 nt2.37□□□□□ -2.03
SOK1P40317 YPR158C-CYPR158C-C 1323 nt2.37□□□□□ -2.03
SOK1P40317 SWR1YDR334W 4545 nt2.37□□□□□ -2.03
SOK1P40317 PUS9YDL036C 1389 nt2.36□□□□□ -2.03
SOK1P40317 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt2.36□□□□□ -2.03
SOK1P40317 AVT2YEL064C 1443 nt2.36□□□□□ -2.03
SOK1P40317 PHO92YDR374C 921 nt2.36□□□□□ -2.03
SOK1P40317 SFH5YJL145W 885 nt2.36□□□□□ -2.03
SOK1P40317 SAW1YAL027W 786 nt2.36□□□□□ -2.03
SOK1P40317 VMA6YLR447C 1038 nt2.36□□□□□ -2.03
SOK1P40317 YMR147WYMR147W 672 nt2.36□□□□□ -2.03
SOK1P40317 snR11snR11 258 nt2.36□□□□□ -2.03
SOK1P40317 YOR062CYOR062C 807 nt2.36□□□□□ -2.03
SOK1P40317 POS5YPL188W 1245 nt2.36□□□□□ -2.03
SOK1P40317 JID1YPR061C 906 nt2.36□□□□□ -2.03
SOK1P40317 YGL176CYGL176C 1665 nt2.36□□□□□ -2.03
SOK1P40317 DUN1YDL101C 1542 nt2.36□□□□□ -2.03
SOK1P40317 YJL132WYJL132W 2253 nt2.35□□□□□ -2.03
SOK1P40317 PDR3YBL005W 2931 nt2.35□□□□□ -2.03
SOK1P40317 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt2.35□□□□□ -2.03
SOK1P40317 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.35□□□□□ -2.03
SOK1P40317 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.35□□□□□ -2.03
SOK1P40317 GCD10YNL062C 1437 nt2.35□□□□□ -2.03
SOK1P40317 YFL041W-AYFL041W-A 192 nt2.35□□□□□ -2.03
SOK1P40317 RNR2YJL026W 1200 nt2.35□□□□□ -2.03
SOK1P40317 YJR020WYJR020W 333 nt2.35□□□□□ -2.03
SOK1P40317 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.35□□□□□ -2.03
SOK1P40317 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt2.35□□□□□ -2.03
SOK1P40317 THI80YOR143C 960 nt2.35□□□□□ -2.03
SOK1P40317 RRG7YOR305W 729 nt2.35□□□□□ -2.03
SOK1P40317 CBP6YBR120C 489 nt2.35□□□□□ -2.03
SOK1P40317 SWD3YBR175W 948 nt2.35□□□□□ -2.03
SOK1P40317 YBR209WYBR209W 318 nt2.35□□□□□ -2.03
SOK1P40317 YDL199CYDL199C 2064 nt2.34□□□□□ -2.03
SOK1P40317 PDR1YGL013C 3207 nt2.34□□□□□ -2.03
SOK1P40317 MMS2YGL087C 414 nt2.34□□□□□ -2.03
SOK1P40317 YGR039WYGR039W 312 nt2.34□□□□□ -2.03
SOK1P40317 MPC3YGR243W 441 nt2.34□□□□□ -2.03
SOK1P40317 YGR273CYGR273C 525 nt2.34□□□□□ -2.03
SOK1P40317 RPL25YOL127W 429 nt2.34□□□□□ -2.03
SOK1P40317 YOR314WYOR314W 330 nt2.34□□□□□ -2.03
SOK1P40317 RRD2YPL152W 1077 nt2.34□□□□□ -2.03
SOK1P40317 CTK1YKL139W 1587 nt2.34□□□□□ -2.03
SOK1P40317 FIR1YER032W 2631 nt2.34□□□□□ -2.04
SOK1P40317 NEW1YPL226W 3591 nt2.33□□□□□ -2.04
SOK1P40317 DUG2YBR281C 2637 nt2.33□□□□□ -2.04
SOK1P40317 RPB9YGL070C 369 nt2.33□□□□□ -2.04
SOK1P40317 YHR213WYHR213W 597 nt2.33□□□□□ -2.04
SOK1P40317 DCG1YIR030C 735 nt2.33□□□□□ -2.04
SOK1P40317 YKR070WYKR070W 1059 nt2.33□□□□□ -2.04
SOK1P40317 SPC3YLR066W 555 nt2.33□□□□□ -2.04
SOK1P40317 MST28YAR033W 705 nt2.33□□□□□ -2.04
SOK1P40317 YAR062WYAR062W 597 nt2.33□□□□□ -2.04
SOK1P40317 RPS1AYLR441C 768 nt2.33□□□□□ -2.04
SOK1P40317 YMR187CYMR187C 1296 nt2.33□□□□□ -2.04
SOK1P40317 RDS2YPL133C 1341 nt2.33□□□□□ -2.04
SOK1P40317 SVL3YPL032C 2478 nt2.32□□□□□ -2.04
SOK1P40317 YCL076WYCL076W 744 nt2.32□□□□□ -2.04
SOK1P40317 ARF1YDL192W 546 nt2.32□□□□□ -2.04
SOK1P40317 BSC2YDR275W 708 nt2.32□□□□□ -2.04
SOK1P40317 OTU2YHL013C 924 nt2.32□□□□□ -2.04
SOK1P40317 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.32□□□□□ -2.04
SOK1P40317 BET3YKR068C 582 nt2.32□□□□□ -2.04
SOK1P40317 SAS2YMR127C 1017 nt2.32□□□□□ -2.04
SOK1P40317 COA2YPL189C-A 207 nt2.32□□□□□ -2.04
SOK1P40317 snR43snR43 209 nt2.32□□□□□ -2.04
SOK1P40317 YNL011CYNL011C 1335 nt2.32□□□□□ -2.04
SOK1P40317 PSD2YGR170W 3417 nt2.31□□□□□ -2.04
SOK1P40317 PTP3YER075C 2787 nt2.31□□□□□ -2.04
SOK1P40317 MRP10YDL045W-A 288 nt2.31□□□□□ -2.04
SOK1P40317 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.31□□□□□ -2.04
SOK1P40317 YKR075CYKR075C 924 nt2.31□□□□□ -2.04
SOK1P40317 ERV41YML067C 1059 nt2.31□□□□□ -2.04
SOK1P40317 RPB8YOR224C 441 nt2.31□□□□□ -2.04
SOK1P40317 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.31□□□□□ -2.04
SOK1P40317 PEX18YHR160C 852 nt2.3□□□□□ -2.04
SOK1P40317 CAB2YIL083C 1098 nt2.3□□□□□ -2.04
SOK1P40317 EMC6YLL014W 327 nt2.3□□□□□ -2.04
SOK1P40317 COS1YNL336W 1146 nt2.3□□□□□ -2.04
SOK1P40317 HSH49YOR319W 642 nt2.3□□□□□ -2.04
SOK1P40317 RRG8YPR116W 834 nt2.3□□□□□ -2.04
SOK1P40317 DAD3YBR233W-A 285 nt2.3□□□□□ -2.04
SOK1P40317 STE24YJR117W 1362 nt2.3□□□□□ -2.04
SOK1P40317 PBI1YPL272C 1554 nt2.3□□□□□ -2.04
SOK1P40317 AEP3YPL005W 1821 nt2.3□□□□□ -2.04
SOK1P40317 YPK1YKL126W 2043 nt2.3□□□□□ -2.04
SOK1P40317 STE11YLR362W 2154 nt2.3□□□□□ -2.04
SOK1P40317 ENP2YGR145W 2124 nt2.29□□□□□ -2.04
SOK1P40317 SKO1YNL167C 1944 nt2.29□□□□□ -2.04
SOK1P40317 PDR11YIL013C 4236 nt2.29□□□□□ -2.04
SOK1P40317 YFH1YDL120W 525 nt2.29□□□□□ -2.04
SOK1P40317 YGR073CYGR073C 372 nt2.29□□□□□ -2.04
SOK1P40317 YAP5YIR018W 738 nt2.29□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 52.2 ms