Protein–RNA interactions for Protein: P25441

RPC53, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, yeast

Predictions only

Length 422 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPC53	P25441	YBL039W-B	YBL039W-B	180 nt		3.38	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	TYE7	YOR344C	876 nt		3.38	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	SSE2	YBR169C	2082 nt		3.38	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	SMC2	YFR031C	3513 nt		3.38	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	IOC3	YFR013W	2364 nt		3.38	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	SPO14	YKR031C	5052 nt		3.37	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	TPO5	YKL174C	1857 nt		3.37	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	MAK5	YBR142W	2322 nt		3.37	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	CHS2	YBR038W	2892 nt		3.37	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	FMN1	YDR236C	657 nt		3.37	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	YLR012C	YLR012C	300 nt		3.37	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	OST6	YML019W	999 nt		3.37	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	YMR316C-A	YMR316C-A	312 nt		3.37	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	YNL109W	YNL109W	546 nt		3.37	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	RUF5-1	RUF5-1	710 nt		3.37	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	RUF5-2	RUF5-2	710 nt		3.37	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	TSR4	YOL022C	1227 nt		3.37	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	ENA2	YDR039C	3276 nt		3.37	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	ENA1	YDR040C	3276 nt		3.37	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	SRP68	YPL243W	1800 nt		3.37	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	MUS81	YDR386W	1899 nt		3.37	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	TCP1	YDR212W	1680 nt		3.36	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	YIR021W-A	YIR021W-A	213 nt		3.36	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	YLL037W	YLL037W	381 nt		3.36	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	GPN3	YLR243W	819 nt		3.36	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	YLR347W-A	YLR347W-A	141 nt		3.36	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	DIA1	YMR316W	1011 nt		3.36	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	SAS5	YOR213C	747 nt		3.36	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	YDR034C-C	YDR034C-C	1317 nt		3.36	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	YLR410W-A	YLR410W-A	1317 nt		3.36	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	ENA5	YDR038C	3276 nt		3.35	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	RPL13A	YDL082W	600 nt		3.35	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	MFA1	YDR461W	111 nt		3.35	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	UPF3	YGR072W	1164 nt		3.35	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	YGR107W	YGR107W	450 nt		3.35	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	RPL24B	YGR148C	468 nt		3.35	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	YAL064W-B	YAL064W-B	381 nt		3.35	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	YLR154C-H	YLR154C-H	132 nt		3.35	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	YLR156C-A	YLR156C-A	132 nt		3.35	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	YLR157C-C	YLR157C-C	132 nt		3.35	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	YLR159C-A	YLR159C-A	132 nt		3.35	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	YMR158C-A	YMR158C-A	138 nt		3.35	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	SRL1	YOR247W	633 nt		3.35	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	SPP382	YLR424W	2127 nt		3.35	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	POL2	YNL262W	6669 nt		3.35	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	ART10	YLR392C	1557 nt		3.34	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	RTT105	YER104W	627 nt		3.34	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	CUP1-1	YHR053C	186 nt		3.34	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	CUP1-2	YHR055C	186 nt		3.34	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	YKL131W	YKL131W	522 nt		3.34	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	RPF2	YKR081C	1035 nt		3.34	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	RHO5	YNL180C	996 nt		3.34	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	CAT5	YOR125C	702 nt		3.34	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	LTP1	YPR073C	486 nt		3.34	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	SAD1	YFR005C	1347 nt		3.34	□□□□□ -1.87
RPC53	P25441	DOA4	YDR069C	2781 nt		3.34	□□□□□ -1.88
RPC53	P25441	DRS2	YAL026C	4068 nt		3.34	□□□□□ -1.88
RPC53	P25441	POL4	YCR014C	1749 nt		3.33	□□□□□ -1.88
RPC53	P25441	RGC1	YPR115W	3252 nt		3.33	□□□□□ -1.88
RPC53	P25441	TOM70	YNL121C	1854 nt		3.33	□□□□□ -1.88
RPC53	P25441	YPD1	YDL235C	504 nt		3.33	□□□□□ -1.88
RPC53	P25441	DIG2	YDR480W	972 nt		3.33	□□□□□ -1.88
RPC53	P25441	YGL204C	YGL204C	306 nt		3.33	□□□□□ -1.88
RPC53	P25441	EFG1	YGR271C-A	702 nt		3.33	□□□□□ -1.88
RPC53	P25441	BMT5	YIL096C	1011 nt		3.33	□□□□□ -1.88
RPC53	P25441	YIL175W	YIL175W	318 nt		3.33	□□□□□ -1.88
RPC53	P25441	DLS1	YJL065C	504 nt		3.33	□□□□□ -1.88
RPC53	P25441	YJL222W-B	YJL222W-B	138 nt		3.33	□□□□□ -1.88
RPC53	P25441	ENV10	YLR065C	546 nt		3.33	□□□□□ -1.88
RPC53	P25441	SSN8	YNL025C	972 nt		3.33	□□□□□ -1.88
RPC53	P25441	YOL162W	YOL162W	648 nt		3.33	□□□□□ -1.88
RPC53	P25441	TPK2	YPL203W	1143 nt		3.33	□□□□□ -1.88
RPC53	P25441	PEX6	YNL329C	3093 nt		3.33	□□□□□ -1.88
RPC53	P25441	AVT5	YBL089W	1380 nt		3.33	□□□□□ -1.88
RPC53	P25441	SYO1	YDL063C	1863 nt		3.33	□□□□□ -1.88
RPC53	P25441	EAP1	YKL204W	1899 nt		3.33	□□□□□ -1.88
RPC53	P25441	YBR259W	YBR259W	2067 nt		3.32	□□□□□ -1.88
RPC53	P25441	YOR296W	YOR296W	3870 nt		3.32	□□□□□ -1.88
RPC53	P25441	YDR034C-D	YDR034C-D	5313 nt		3.32	□□□□□ -1.88
RPC53	P25441	CSR2	YPR030W	3366 nt		3.32	□□□□□ -1.88
RPC53	P25441	YFH7	YFR007W	1062 nt		3.32	□□□□□ -1.88
RPC53	P25441	PIR1	YKL164C	1026 nt		3.32	□□□□□ -1.88
RPC53	P25441	YPL135C-A	YPL135C-A	174 nt		3.32	□□□□□ -1.88
RPC53	P25441	ARO4	YBR249C	1113 nt		3.32	□□□□□ -1.88
RPC53	P25441	APA1	YCL050C	966 nt		3.32	□□□□□ -1.88
RPC53	P25441	CDH1	YGL003C	1701 nt		3.32	□□□□□ -1.88
RPC53	P25441	EXO84	YBR102C	2262 nt		3.31	□□□□□ -1.88
RPC53	P25441	BCH1	YMR237W	2175 nt		3.31	□□□□□ -1.88
RPC53	P25441	MDM10	YAL010C	1482 nt		3.31	□□□□□ -1.88
RPC53	P25441	YNL011C	YNL011C	1335 nt		3.31	□□□□□ -1.88
RPC53	P25441	YDL032W	YDL032W	312 nt		3.31	□□□□□ -1.88
RPC53	P25441	YGL242C	YGL242C	546 nt		3.31	□□□□□ -1.88
RPC53	P25441	YKL065W-A	YKL065W-A	222 nt		3.31	□□□□□ -1.88
RPC53	P25441	YLR076C	YLR076C	423 nt		3.31	□□□□□ -1.88
RPC53	P25441	FRE8	YLR047C	2061 nt		3.31	□□□□□ -1.88
RPC53	P25441	JJJ1	YNL227C	1773 nt		3.3	□□□□□ -1.88
RPC53	P25441	BNI4	YNL233W	2679 nt		3.3	□□□□□ -1.88
RPC53	P25441	RIX1	YHR197W	2292 nt		3.3	□□□□□ -1.88
RPC53	P25441	RPN9	YDR427W	1182 nt		3.3	□□□□□ -1.88
RPC53	P25441	COG7	YGL005C	840 nt		3.3	□□□□□ -1.88

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