Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
TNIKQ9UKE5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC34.51■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
TNIKQ9UKE5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms