Protein–RNA interactions for Protein: Q12200

NCR1, NPC intracellular cholesterol transporter 1-related protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NCR1Q12200 DIA3YDL024C 1407 nt6.33□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 SPE1YKL184W 1401 nt6.33□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 URA7YBL039C 1740 nt6.33□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt6.33□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 THI4YGR144W 981 nt6.33□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 CCP1YKR066C 1086 nt6.33□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 IST1YNL265C 897 nt6.33□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 YPL114WYPL114W 420 nt6.33□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 RMD9YGL107C 1941 nt6.33□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 HCS1YKL017C 2052 nt6.32□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 ASI3YNL008C 2031 nt6.32□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 COX4YGL187C 468 nt6.32□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 SPG4YMR107W 348 nt6.32□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt6.32□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 NOP15YNL110C 663 nt6.32□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 VIK1YPL253C 1944 nt6.32□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 YHL017WYHL017W 1599 nt6.31□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 ALT2YDR111C 1524 nt6.31□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 THI22YPR121W 1719 nt6.31□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 SUP35YDR172W 2058 nt6.31□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 ATO3YDR384C 828 nt6.31□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 YFR056CYFR056C 369 nt6.31□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 YJR128WYJR128W 360 nt6.31□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 PEX17YNL214W 600 nt6.31□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 YBL108WYBL108W 306 nt6.31□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 BAR1YIL015W 1764 nt6.31□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 RAD3YER171W 2337 nt6.3□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 PGK1YCR012W 1251 nt6.3□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 YFH1YDL120W 525 nt6.3□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 ERG28YER044C 447 nt6.3□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 VMA10YHR039C-A 345 nt6.3□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 SGN1YIR001C 753 nt6.3□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 RPS0BYLR048W 759 nt6.3□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt6.3□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 HSP78YDR258C 2436 nt6.29□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 XBP1YIL101C 1944 nt6.29□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 YDR090CYDR090C 933 nt6.29□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 YEL067CYEL067C 588 nt6.29□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 YER076CYER076C 909 nt6.29□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 MLC1YGL106W 450 nt6.29□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 YGR022CYGR022C 330 nt6.29□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 MTM1YGR257C 1101 nt6.29□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 DPH1YIL103W 1278 nt6.29□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 YJL086CYJL086C 369 nt6.29□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 CIS3YJL158C 684 nt6.29□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 REE1YJL217W 597 nt6.29□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 YBL055CYBL055C 1257 nt6.29□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 YML082WYML082W 1950 nt6.29□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 MMT1YMR177W 1533 nt6.29□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 YFR006WYFR006W 1608 nt6.28□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 SPP382YLR424W 2127 nt6.28□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 PKC1YBL105C 3456 nt6.28□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 YRA1YDR381W 681 nt6.28□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 CBP4YGR174C 513 nt6.28□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 NSG1YHR133C 876 nt6.28□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 IDH2YOR136W 1110 nt6.28□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 ESC8YOL017W 2145 nt6.28□□□□□ -1.4
NCR1Q12200 BUD5YCR038C 1929 nt6.27□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 YDR154CYDR154C 351 nt6.27□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 YER148W-AYER148W-A 579 nt6.27□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 ZRT1YGL255W 1131 nt6.27□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 RPL8AYHL033C 771 nt6.27□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 ENV9YOR246C 993 nt6.27□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 PYC1YGL062W 3537 nt6.26□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 QNS1YHR074W 2145 nt6.26□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 PIG2YIL045W 1617 nt6.26□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 JIP4YDR475C 2631 nt6.26□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 GPB2YAL056W 2643 nt6.26□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 DSN1YIR010W 1731 nt6.26□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 YEL075CYEL075C 369 nt6.26□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 CAJ1YER048C 1176 nt6.26□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 VTC1YER072W 390 nt6.26□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 YER085CYER085C 522 nt6.26□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 YER189WYER189W 369 nt6.26□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 YGL193CYGL193C 312 nt6.26□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt6.26□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 DPB3YBR278W 606 nt6.26□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 MVP1YMR004W 1536 nt6.25□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 HSP30YCR021C 999 nt6.25□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt6.25□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 SUP2tY(GUA)D 75 nt6.25□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 SUP11tY(GUA)F1 75 nt6.25□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 SUP6tY(GUA)F2 75 nt6.25□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 SUP7tY(GUA)J1 75 nt6.25□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 SUP4tY(GUA)J2 75 nt6.25□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 SUP5tY(GUA)M1 75 nt6.25□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 SUP8tY(GUA)M2 75 nt6.25□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 SUP3tY(GUA)O 75 nt6.25□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 FET4YMR319C 1659 nt6.25□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 UTP9YHR196W 1728 nt6.25□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 PAT1YCR077C 2391 nt6.24□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 GCD2YGR083C 1956 nt6.24□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 AMA1YGR225W 1782 nt6.24□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 ATG21YPL100W 1491 nt6.24□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 SMX2YFL017W-A 234 nt6.24□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 YIL012WYIL012W 342 nt6.24□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 PAN6YIL145C 930 nt6.24□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 TIR2YOR010C 756 nt6.24□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 FET3YMR058W 1911 nt6.24□□□□□ -1.41
NCR1Q12200 IMA5YJL216C 1746 nt6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 126.1 ms