Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
GTF2E1P29083 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms