Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
ARID3CA6NKF2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ARID3CA6NKF2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
ARID3CA6NKF2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms