Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC62Q6P9F0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC62Q6P9F0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms