Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPRKQ15262 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
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