Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
GRIN2AQ12879 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
GRIN2AQ12879 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
GRIN2AQ12879 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
GRIN2AQ12879 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
GRIN2AQ12879 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
GRIN2AQ12879 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
GRIN2AQ12879 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
GRIN2AQ12879 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC34.78■■■■□ 3.16
GRIN2AQ12879 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC34.78■■■■□ 3.16
GRIN2AQ12879 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
GRIN2AQ12879 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
GRIN2AQ12879 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
GRIN2AQ12879 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
GRIN2AQ12879 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
GRIN2AQ12879 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
GRIN2AQ12879 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC34.72■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC34.72■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
GRIN2AQ12879 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC34.69■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
GRIN2AQ12879 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
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