Protein–RNA interactions for Protein: P55075

FGF8, Fibroblast growth factor 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF8P55075 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FGF8P55075 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FGF8P55075 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FGF8P55075 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FGF8P55075 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FGF8P55075 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FGF8P55075 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FGF8P55075 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FGF8P55075 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FGF8P55075 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FGF8P55075 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FGF8P55075 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FGF8P55075 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FGF8P55075 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FGF8P55075 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FGF8P55075 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FGF8P55075 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FGF8P55075 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FGF8P55075 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FGF8P55075 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FGF8P55075 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FGF8P55075 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FGF8P55075 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FGF8P55075 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FGF8P55075 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FGF8P55075 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FGF8P55075 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FGF8P55075 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FGF8P55075 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FGF8P55075 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FGF8P55075 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FGF8P55075 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FGF8P55075 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FGF8P55075 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FGF8P55075 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FGF8P55075 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FGF8P55075 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FGF8P55075 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FGF8P55075 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FGF8P55075 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FGF8P55075 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FGF8P55075 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FGF8P55075 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FGF8P55075 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FGF8P55075 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FGF8P55075 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FGF8P55075 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FGF8P55075 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FGF8P55075 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FGF8P55075 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FGF8P55075 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FGF8P55075 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FGF8P55075 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FGF8P55075 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FGF8P55075 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FGF8P55075 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FGF8P55075 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FGF8P55075 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FGF8P55075 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FGF8P55075 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FGF8P55075 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FGF8P55075 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FGF8P55075 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FGF8P55075 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FGF8P55075 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FGF8P55075 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FGF8P55075 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FGF8P55075 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FGF8P55075 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FGF8P55075 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FGF8P55075 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FGF8P55075 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FGF8P55075 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FGF8P55075 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FGF8P55075 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FGF8P55075 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FGF8P55075 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FGF8P55075 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FGF8P55075 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FGF8P55075 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FGF8P55075 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FGF8P55075 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FGF8P55075 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FGF8P55075 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FGF8P55075 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FGF8P55075 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FGF8P55075 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FGF8P55075 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FGF8P55075 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FGF8P55075 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FGF8P55075 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FGF8P55075 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FGF8P55075 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FGF8P55075 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FGF8P55075 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FGF8P55075 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FGF8P55075 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FGF8P55075 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FGF8P55075 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FGF8P55075 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms