Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ITGAEP38570 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ITGAEP38570 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1015 ms