Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00271P0C7V0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms