Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.32■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.32■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.32■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.31■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.3■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.29■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.29■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.29■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.29■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.28■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.28■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP30Q70CQ3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms