Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
PTPRKQ15262 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PTPRKQ15262 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRKQ15262 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
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