Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP1P59025 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP1P59025 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP1P59025 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP1P59025 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP1P59025 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP1P59025 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP1P59025 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP1P59025 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP1P59025 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP1P59025 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP1P59025 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP1P59025 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTP1P59025 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTP1P59025 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RTP1P59025 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RTP1P59025 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTP1P59025 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RTP1P59025 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RTP1P59025 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTP1P59025 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RTP1P59025 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RTP1P59025 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTP1P59025 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTP1P59025 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTP1P59025 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTP1P59025 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RTP1P59025 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RTP1P59025 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTP1P59025 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RTP1P59025 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTP1P59025 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTP1P59025 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTP1P59025 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTP1P59025 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTP1P59025 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTP1P59025 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTP1P59025 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTP1P59025 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTP1P59025 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTP1P59025 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTP1P59025 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTP1P59025 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RTP1P59025 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTP1P59025 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTP1P59025 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTP1P59025 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTP1P59025 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTP1P59025 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTP1P59025 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTP1P59025 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RTP1P59025 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTP1P59025 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTP1P59025 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTP1P59025 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTP1P59025 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTP1P59025 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTP1P59025 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTP1P59025 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTP1P59025 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTP1P59025 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTP1P59025 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTP1P59025 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTP1P59025 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTP1P59025 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RTP1P59025 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTP1P59025 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTP1P59025 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTP1P59025 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RTP1P59025 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTP1P59025 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTP1P59025 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTP1P59025 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTP1P59025 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RTP1P59025 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTP1P59025 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTP1P59025 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTP1P59025 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTP1P59025 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTP1P59025 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTP1P59025 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTP1P59025 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RTP1P59025 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTP1P59025 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTP1P59025 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTP1P59025 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTP1P59025 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTP1P59025 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTP1P59025 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTP1P59025 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTP1P59025 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTP1P59025 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RTP1P59025 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RTP1P59025 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RTP1P59025 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTP1P59025 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTP1P59025 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTP1P59025 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTP1P59025 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTP1P59025 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms