Protein–RNA interactions for Protein: P40317

SOK1, Protein SOK1, yeastyeast

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SOK1P40317 YML045WYML045W 5268 nt2.65□□□□□ -1.99
SOK1P40317 YMR050CYMR050C 5268 nt2.65□□□□□ -1.99
SOK1P40317 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.65□□□□□ -1.99
SOK1P40317 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.65□□□□□ -1.99
SOK1P40317 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.65□□□□□ -1.99
SOK1P40317 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.65□□□□□ -1.99
SOK1P40317 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.65□□□□□ -1.99
SOK1P40317 NSA1YGL111W 1392 nt2.64□□□□□ -1.99
SOK1P40317 GYP7YDL234C 2241 nt2.64□□□□□ -1.99
SOK1P40317 YCL068CYCL068C 783 nt2.64□□□□□ -1.99
SOK1P40317 TAM41YGR046W 1158 nt2.64□□□□□ -1.99
SOK1P40317 SMA2YML066C 1110 nt2.64□□□□□ -1.99
SOK1P40317 COX14YML129C 213 nt2.64□□□□□ -1.99
SOK1P40317 RCE1YMR274C 948 nt2.64□□□□□ -1.99
SOK1P40317 LCL1YPL056C 306 nt2.64□□□□□ -1.99
SOK1P40317 USV1YPL230W 1176 nt2.64□□□□□ -1.99
SOK1P40317 CAF120YNL278W 3183 nt2.64□□□□□ -1.99
SOK1P40317 RRP8YDR083W 1179 nt2.63□□□□□ -1.99
SOK1P40317 NSA2YER126C 786 nt2.63□□□□□ -1.99
SOK1P40317 PEF1YGR058W 1008 nt2.63□□□□□ -1.99
SOK1P40317 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt2.63□□□□□ -1.99
SOK1P40317 RIM9YMR063W 720 nt2.63□□□□□ -1.99
SOK1P40317 YMR087WYMR087W 855 nt2.63□□□□□ -1.99
SOK1P40317 YNL109WYNL109W 546 nt2.63□□□□□ -1.99
SOK1P40317 INO4YOL108C 456 nt2.63□□□□□ -1.99
SOK1P40317 SIN4YNL236W 2925 nt2.62□□□□□ -1.99
SOK1P40317 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt2.62□□□□□ -1.99
SOK1P40317 IMG2YCR071C 441 nt2.62□□□□□ -1.99
SOK1P40317 HMF1YER057C 390 nt2.62□□□□□ -1.99
SOK1P40317 CSM2YIL132C 642 nt2.62□□□□□ -1.99
SOK1P40317 YIL174WYIL174W 228 nt2.62□□□□□ -1.99
SOK1P40317 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.62□□□□□ -1.99
SOK1P40317 ATG3YNR007C 933 nt2.62□□□□□ -1.99
SOK1P40317 YOL079WYOL079W 399 nt2.62□□□□□ -1.99
SOK1P40317 MPD2YOL088C 834 nt2.62□□□□□ -1.99
SOK1P40317 RPL33AYPL143W 324 nt2.62□□□□□ -1.99
SOK1P40317 PSY2YNL201C 2577 nt2.62□□□□□ -1.99
SOK1P40317 DIA2YOR080W 2199 nt2.61□□□□□ -1.99
SOK1P40317 SMT3YDR510W 306 nt2.61□□□□□ -1.99
SOK1P40317 HPA3YEL066W 540 nt2.61□□□□□ -1.99
SOK1P40317 SDT1YGL224C 843 nt2.61□□□□□ -1.99
SOK1P40317 RPL17BYJL177W 555 nt2.61□□□□□ -1.99
SOK1P40317 RSM19YNR037C 276 nt2.61□□□□□ -1.99
SOK1P40317 AIM39YOL053W 1188 nt2.61□□□□□ -1.99
SOK1P40317 CWC22YGR278W 1734 nt2.61□□□□□ -1.99
SOK1P40317 YPR148CYPR148C 1308 nt2.61□□□□□ -1.99
SOK1P40317 SLH1YGR271W 5904 nt2.6□□□□□ -1.99
SOK1P40317 MTL1YGR023W 1656 nt2.6□□□□□ -1.99
SOK1P40317 RSE1YML049C 4086 nt2.6□□□□□ -1.99
SOK1P40317 MED1YPR070W 1701 nt2.6□□□□□ -1.99
SOK1P40317 PBS2YJL128C 2007 nt2.6□□□□□ -1.99
SOK1P40317 ECM21YBL101C 3354 nt2.6□□□□□ -1.99
SOK1P40317 ICR1ICR1 3199 nt2.6□□□□□ -1.99
SOK1P40317 RDI1YDL135C 609 nt2.59□□□□□ -1.99
SOK1P40317 YEL028WYEL028W 462 nt2.59□□□□□ -1.99
SOK1P40317 USB1YLR132C 873 nt2.59□□□□□ -1.99
SOK1P40317 AAH1YNL141W 1044 nt2.59□□□□□ -1.99
SOK1P40317 YIL092WYIL092W 1902 nt2.59□□□□□ -1.99
SOK1P40317 NET1YJL076W 3570 nt2.59□□□□□ -1.99
SOK1P40317 AXL1YPR122W 3627 nt2.59□□□□□ -2
SOK1P40317 ISW1YBR245C 3390 nt2.59□□□□□ -2
SOK1P40317 YDR239CYDR239C 2364 nt2.59□□□□□ -2
SOK1P40317 ESC1YMR219W 4977 nt2.59□□□□□ -2
SOK1P40317 YIP5YGL161C 933 nt2.58□□□□□ -2
SOK1P40317 CFD1YIL003W 882 nt2.58□□□□□ -2
SOK1P40317 YKR033CYKR033C 426 nt2.58□□□□□ -2
SOK1P40317 INP1YMR204C 1263 nt2.58□□□□□ -2
SOK1P40317 HUB1YNR032C-A 222 nt2.58□□□□□ -2
SOK1P40317 MCA1YOR197W 1299 nt2.58□□□□□ -2
SOK1P40317 ATG29YPL166W 642 nt2.58□□□□□ -2
SOK1P40317 SHE3YBR130C 1278 nt2.58□□□□□ -2
SOK1P40317 MET5YJR137C 4329 nt2.58□□□□□ -2
SOK1P40317 RIX1YHR197W 2292 nt2.58□□□□□ -2
SOK1P40317 MET6YER091C 2304 nt2.58□□□□□ -2
SOK1P40317 YBR138CYBR138C 1575 nt2.57□□□□□ -2
SOK1P40317 MSB2YGR014W 3921 nt2.57□□□□□ -2
SOK1P40317 BUR6YER159C 429 nt2.57□□□□□ -2
SOK1P40317 EFG1YGR271C-A 702 nt2.57□□□□□ -2
SOK1P40317 RPL14BYHL001W 417 nt2.57□□□□□ -2
SOK1P40317 SYS1YJL004C 612 nt2.57□□□□□ -2
SOK1P40317 YLR326WYLR326W 723 nt2.57□□□□□ -2
SOK1P40317 GLO1YML004C 981 nt2.57□□□□□ -2
SOK1P40317 VAC14YLR386W 2643 nt2.57□□□□□ -2
SOK1P40317 APM1YPL259C 1428 nt2.57□□□□□ -2
SOK1P40317 RGR1YLR071C 3249 nt2.57□□□□□ -2
SOK1P40317 VAC8YEL013W 1737 nt2.56□□□□□ -2
SOK1P40317 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.56□□□□□ -2
SOK1P40317 PRP8YHR165C 7242 nt2.56□□□□□ -2
SOK1P40317 RPL24BYGR148C 468 nt2.56□□□□□ -2
SOK1P40317 YJL028WYJL028W 336 nt2.56□□□□□ -2
SOK1P40317 GPI14YJR013W 1212 nt2.56□□□□□ -2
SOK1P40317 RPS31YLR167W 459 nt2.56□□□□□ -2
SOK1P40317 JIP3YLR331C 378 nt2.56□□□□□ -2
SOK1P40317 SAM37YMR060C 984 nt2.56□□□□□ -2
SOK1P40317 MRPL24YMR193W 777 nt2.56□□□□□ -2
SOK1P40317 MRPL33YMR286W 261 nt2.56□□□□□ -2
SOK1P40317 YOR331CYOR331C 558 nt2.56□□□□□ -2
SOK1P40317 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.56□□□□□ -2
SOK1P40317 CLD1YGR110W 1338 nt2.56□□□□□ -2
SOK1P40317 ORC1YML065W 2745 nt2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.5 ms