Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TAF1P21675 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TAF1P21675 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TAF1P21675 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TAF1P21675 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TAF1P21675 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF1P21675 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF1P21675 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF1P21675 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF1P21675 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF1P21675 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF1P21675 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF1P21675 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF1P21675 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF1P21675 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF1P21675 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF1P21675 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TAF1P21675 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TAF1P21675 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TAF1P21675 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TAF1P21675 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TAF1P21675 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TAF1P21675 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TAF1P21675 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TAF1P21675 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TAF1P21675 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TAF1P21675 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TAF1P21675 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TAF1P21675 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TAF1P21675 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TAF1P21675 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TAF1P21675 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TAF1P21675 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF1P21675 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF1P21675 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF1P21675 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF1P21675 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF1P21675 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF1P21675 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF1P21675 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF1P21675 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF1P21675 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF1P21675 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF1P21675 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF1P21675 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF1P21675 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF1P21675 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF1P21675 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TAF1P21675 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TAF1P21675 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TAF1P21675 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TAF1P21675 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TAF1P21675 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TAF1P21675 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TAF1P21675 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TAF1P21675 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TAF1P21675 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TAF1P21675 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.8
TAF1P21675 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
TAF1P21675 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF1P21675 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF1P21675 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF1P21675 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF1P21675 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF1P21675 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF1P21675 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF1P21675 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF1P21675 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF1P21675 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF1P21675 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF1P21675 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF1P21675 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF1P21675 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF1P21675 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF1P21675 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF1P21675 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF1P21675 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF1P21675 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF1P21675 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF1P21675 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF1P21675 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF1P21675 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF1P21675 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF1P21675 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF1P21675 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF1P21675 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF1P21675 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF1P21675 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF1P21675 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF1P21675 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF1P21675 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF1P21675 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF1P21675 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF1P21675 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF1P21675 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF1P21675 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF1P21675 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF1P21675 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TAF1P21675 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TAF1P21675 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms