Protein–RNA interactions for Protein: A6NIU2

LINC01549, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01549, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01549A6NIU2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC01549A6NIU2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC01549A6NIU2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01549A6NIU2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01549A6NIU2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01549A6NIU2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01549A6NIU2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01549A6NIU2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01549A6NIU2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01549A6NIU2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01549A6NIU2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01549A6NIU2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01549A6NIU2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01549A6NIU2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 199.1 ms