Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDK12Q9NYV4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDK12Q9NYV4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CDK12Q9NYV4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDK12Q9NYV4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDK12Q9NYV4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDK12Q9NYV4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDK12Q9NYV4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CDK12Q9NYV4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDK12Q9NYV4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.4 ms