Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NUDCD1Q96RS6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms