Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRSAM1Q6UWE0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRSAM1Q6UWE0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.2 ms