Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIF1AQ16665 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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