Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC35.07■■■■□ 3.21
EEA1Q15075 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC35.02■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC35.01■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
EEA1Q15075 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms