Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL19A1Q14993 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
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