Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CUL4AQ13619 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CUL4AQ13619 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
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