Protein–RNA interactions for Protein: Q12269

TY1B-GR2, Transposon Ty1-GR2 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-GR2Q12269 SSO2YMR183C 888 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1B-GR2Q12269 CTF4YPR135W 2784 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1B-GR2Q12269 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1B-GR2Q12269 RTT107YHR154W 3213 nt3.22□□□□□ -1.89
TY1B-GR2Q12269 RPL17BYJL177W 555 nt3.22□□□□□ -1.89
TY1B-GR2Q12269 SWC7YLR385C 399 nt3.22□□□□□ -1.89
TY1B-GR2Q12269 snR83snR83 306 nt3.21□□□□□ -1.9
TY1B-GR2Q12269 CIR1YGR207C 786 nt3.21□□□□□ -1.9
TY1B-GR2Q12269 APN2YBL019W 1563 nt3.21□□□□□ -1.9
TY1B-GR2Q12269 RPO21YDL140C 5202 nt3.21□□□□□ -1.9
TY1B-GR2Q12269 YSP2YDR326C 4317 nt3.2□□□□□ -1.9
TY1B-GR2Q12269 STE14YDR410C 720 nt3.2□□□□□ -1.9
TY1B-GR2Q12269 ISC10YER180C 804 nt3.2□□□□□ -1.9
TY1B-GR2Q12269 YKL131WYKL131W 522 nt3.2□□□□□ -1.9
TY1B-GR2Q12269 KHA1YJL094C 2622 nt3.2□□□□□ -1.9
TY1B-GR2Q12269 BNA4YBL098W 1383 nt3.2□□□□□ -1.9
TY1B-GR2Q12269 EMI1YDR512C 564 nt3.2□□□□□ -1.9
TY1B-GR2Q12269 RSM19YNR037C 276 nt3.2□□□□□ -1.9
TY1B-GR2Q12269 RCY1YJL204C 2523 nt3.2□□□□□ -1.9
TY1B-GR2Q12269 YDR261C-DYDR261C-D 4815 nt3.19□□□□□ -1.9
TY1B-GR2Q12269 TOR1YJR066W 7413 nt3.19□□□□□ -1.9
TY1B-GR2Q12269 YBR259WYBR259W 2067 nt3.19□□□□□ -1.9
TY1B-GR2Q12269 PRP8YHR165C 7242 nt3.19□□□□□ -1.9
TY1B-GR2Q12269 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt3.19□□□□□ -1.9
TY1B-GR2Q12269 PFY1YOR122C 381 nt3.19□□□□□ -1.9
TY1B-GR2Q12269 KAP95YLR347C 2586 nt3.18□□□□□ -1.9
TY1B-GR2Q12269 YGL159WYGL159W 1113 nt3.18□□□□□ -1.9
TY1B-GR2Q12269 WHI4YDL224C 1950 nt3.18□□□□□ -1.9
TY1B-GR2Q12269 PEP7YDR323C 1548 nt3.18□□□□□ -1.9
TY1B-GR2Q12269 BUD2YKL092C 3315 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1B-GR2Q12269 SBE22YHR103W 2559 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1B-GR2Q12269 KAR5YMR065W 1515 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1B-GR2Q12269 RFC5YBR087W 1065 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1B-GR2Q12269 ECM5YMR176W 4236 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1B-GR2Q12269 ELP3YPL086C 1674 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1B-GR2Q12269 TAF6YGL112C 1551 nt3.16□□□□□ -1.9
TY1B-GR2Q12269 PML39YML107C 1005 nt3.16□□□□□ -1.9
TY1B-GR2Q12269 FYV12YOR183W 390 nt3.16□□□□□ -1.9
TY1B-GR2Q12269 SQS1YNL224C 2304 nt3.16□□□□□ -1.9
TY1B-GR2Q12269 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt3.15□□□□□ -1.9
TY1B-GR2Q12269 Q0010Q0010 387 nt3.15□□□□□ -1.9
TY1B-GR2Q12269 YBR139WYBR139W 1527 nt3.15□□□□□ -1.9
TY1B-GR2Q12269 VPS27YNR006W 1869 nt3.15□□□□□ -1.91
TY1B-GR2Q12269 ARD1YHR013C 717 nt3.15□□□□□ -1.91
TY1B-GR2Q12269 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt3.15□□□□□ -1.91
TY1B-GR2Q12269 RPL25YOL127W 429 nt3.15□□□□□ -1.91
TY1B-GR2Q12269 BPT1YLL015W 4680 nt3.14□□□□□ -1.91
TY1B-GR2Q12269 MYO4YAL029C 4416 nt3.14□□□□□ -1.91
TY1B-GR2Q12269 SAT4YCR008W 1812 nt3.14□□□□□ -1.91
TY1B-GR2Q12269 SKM1YOL113W 1968 nt3.14□□□□□ -1.91
TY1B-GR2Q12269 PDS1YDR113C 1122 nt3.14□□□□□ -1.91
TY1B-GR2Q12269 RPS7AYOR096W 573 nt3.14□□□□□ -1.91
TY1B-GR2Q12269 YER133W-AYER133W-A 342 nt3.13□□□□□ -1.91
TY1B-GR2Q12269 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt3.13□□□□□ -1.91
TY1B-GR2Q12269 YBR103C-AYBR103C-A 144 nt3.13□□□□□ -1.91
TY1B-GR2Q12269 SEC6YIL068C 2418 nt3.13□□□□□ -1.91
TY1B-GR2Q12269 YAR009CYAR009C 3591 nt3.13□□□□□ -1.91
TY1B-GR2Q12269 NVJ1YHR195W 966 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1B-GR2Q12269 DYN2YDR424C 279 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1B-GR2Q12269 ATG19YOL082W 1248 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1B-GR2Q12269 HST2YPL015C 1074 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1B-GR2Q12269 ALG14YBR070C 714 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1B-GR2Q12269 ADR1YDR216W 3972 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1B-GR2Q12269 YHR177WYHR177W 1362 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1B-GR2Q12269 TRM3YDL112W 4311 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1B-GR2Q12269 HRD1YOL013C 1656 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1B-GR2Q12269 HRD3YLR207W 2502 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1B-GR2Q12269 PUT2YHR037W 1728 nt3.11□□□□□ -1.91
TY1B-GR2Q12269 FMP10YER182W 735 nt3.11□□□□□ -1.91
TY1B-GR2Q12269 YHL045WYHL045W 348 nt3.11□□□□□ -1.91
TY1B-GR2Q12269 YHR210CYHR210C 1026 nt3.11□□□□□ -1.91
TY1B-GR2Q12269 YKT6YKL196C 603 nt3.11□□□□□ -1.91
TY1B-GR2Q12269 AMS1YGL156W 3252 nt3.11□□□□□ -1.91
TY1B-GR2Q12269 OAF3YKR064W 2592 nt3.1□□□□□ -1.91
TY1B-GR2Q12269 SMA1YPL027W 738 nt3.1□□□□□ -1.91
TY1B-GR2Q12269 IXR1YKL032C 1794 nt3.1□□□□□ -1.91
TY1B-GR2Q12269 UBP6YFR010W 1500 nt3.1□□□□□ -1.91
TY1B-GR2Q12269 FAS1YKL182W 6156 nt3.1□□□□□ -1.91
TY1B-GR2Q12269 ARP7YPR034W 1434 nt3.09□□□□□ -1.91
TY1B-GR2Q12269 NSA1YGL111W 1392 nt3.09□□□□□ -1.91
TY1B-GR2Q12269 GIP1YBR045C 1920 nt3.09□□□□□ -1.92
TY1B-GR2Q12269 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt3.09□□□□□ -1.92
TY1B-GR2Q12269 MRP8YKL142W 660 nt3.08□□□□□ -1.92
TY1B-GR2Q12269 RPS28BYLR264W 204 nt3.08□□□□□ -1.92
TY1B-GR2Q12269 RRG8YPR116W 834 nt3.08□□□□□ -1.92
TY1B-GR2Q12269 YDR149CYDR149C 708 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1B-GR2Q12269 THO1YER063W 657 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1B-GR2Q12269 YKL091CYKL091C 933 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1B-GR2Q12269 HUG1YML058W-A 207 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1B-GR2Q12269 DGR1YNL130C-A 147 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1B-GR2Q12269 YPR053CYPR053C 456 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1B-GR2Q12269 PCL8YPL219W 1479 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1B-GR2Q12269 COS111YBR203W 2775 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1B-GR2Q12269 SEF1YBL066C 3447 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1B-GR2Q12269 NUP192YJL039C 5052 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1B-GR2Q12269 ISM1YPL040C 3009 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1B-GR2Q12269 PDX1YGR193C 1233 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1B-GR2Q12269 RPL36AYMR194W 303 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1B-GR2Q12269 YPL088WYPL088W 1029 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1B-GR2Q12269 RNA14YMR061W 2034 nt3.07□□□□□ -1.92
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