Protein–RNA interactions for Protein: Q03785

VHS1, Serine/threonine-protein kinase VHS1, yeastyeast

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1Q03785 BUD6YLR319C 2367 nt3.16□□□□□ -1.9
VHS1Q03785 ALG1YBR110W 1350 nt3.16□□□□□ -1.9
VHS1Q03785 MEF1YLR069C 2286 nt3.16□□□□□ -1.9
VHS1Q03785 SKP2YNL311C 2292 nt3.16□□□□□ -1.9
VHS1Q03785 MIT1YEL007W 2001 nt3.16□□□□□ -1.9
VHS1Q03785 YCL076WYCL076W 744 nt3.16□□□□□ -1.9
VHS1Q03785 TOS8YGL096W 831 nt3.16□□□□□ -1.9
VHS1Q03785 COS8YHL048W 1146 nt3.16□□□□□ -1.9
VHS1Q03785 FMC1YIL098C 468 nt3.16□□□□□ -1.9
VHS1Q03785 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt3.16□□□□□ -1.9
VHS1Q03785 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt3.16□□□□□ -1.9
VHS1Q03785 YML094C-AYML094C-A 402 nt3.16□□□□□ -1.9
VHS1Q03785 HAT1YPL001W 1125 nt3.16□□□□□ -1.9
VHS1Q03785 TAZ1YPR140W 1146 nt3.16□□□□□ -1.9
VHS1Q03785 RPN1YHR027C 2982 nt3.16□□□□□ -1.9
VHS1Q03785 PWP2YCR057C 2772 nt3.16□□□□□ -1.9
VHS1Q03785 YSP2YDR326C 4317 nt3.15□□□□□ -1.9
VHS1Q03785 PSF1YDR013W 627 nt3.15□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 YHR180WYHR180W 492 nt3.15□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt3.15□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 YLR444CYLR444C 303 nt3.15□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 IDH2YOR136W 1110 nt3.15□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 YMR317WYMR317W 3423 nt3.15□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 SAD1YFR005C 1347 nt3.15□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 KTR6YPL053C 1341 nt3.15□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 CHA4YLR098C 1947 nt3.15□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 SLS1YLR139C 1932 nt3.15□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 STE6YKL209C 3873 nt3.15□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 CLG1YGL215W 1359 nt3.14□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 SER3YER081W 1410 nt3.14□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 Q0255Q0255 1419 nt3.14□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 YCR007CYCR007C 720 nt3.14□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 RAD55YDR076W 1221 nt3.14□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 CDC26YFR036W 375 nt3.14□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 YGL218WYGL218W 651 nt3.14□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 YHI9YHR029C 885 nt3.14□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 YKL162CYKL162C 1209 nt3.14□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 REH1YLR387C 1299 nt3.14□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 UFE1YOR075W 1041 nt3.14□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 MED8YBR193C 672 nt3.14□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 MNR2YKL064W 2910 nt3.14□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 POL2YNL262W 6669 nt3.14□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 ISC10YER180C 804 nt3.13□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 YBR013CYBR013C 390 nt3.13□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 DIB1YPR082C 432 nt3.13□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 HAP4YKL109W 1665 nt3.13□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 ACK1YDL203C 1872 nt3.13□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 FAR1YJL157C 2493 nt3.13□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 DRS2YAL026C 4068 nt3.13□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 RCY1YJL204C 2523 nt3.13□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 ETP1YHL010C 1758 nt3.12□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 RPA135YPR010C 3612 nt3.12□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 CHO2YGR157W 2610 nt3.12□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 YDL180WYDL180W 1644 nt3.12□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 YFL040WYFL040W 1623 nt3.12□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 ENA2YDR039C 3276 nt3.12□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 ENA1YDR040C 3276 nt3.12□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 PRS5YOL061W 1491 nt3.12□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 YFR032C-BYFR032C-B 264 nt3.12□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 RPS21AYKR057W 264 nt3.12□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 SPC2YML055W 537 nt3.12□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 MRPS17YMR188C 714 nt3.12□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 RPL18AYOL120C 561 nt3.12□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 RFM1YOR279C 933 nt3.12□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 SFG1YOR315W 1041 nt3.12□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 NIP7YPL211W 546 nt3.12□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 YOR296WYOR296W 3870 nt3.12□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 PST1YDR055W 1335 nt3.12□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 YNR066CYNR066C 1311 nt3.12□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 ART10YLR392C 1557 nt3.12□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 YVC1YOR087W 2028 nt3.12□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 DOA4YDR069C 2781 nt3.12□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 NUP85YJR042W 2235 nt3.11□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 DSF2YBR007C 2211 nt3.11□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 DTD1YDL219W 453 nt3.11□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 NSA2YER126C 786 nt3.11□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 YGL082WYGL082W 1146 nt3.11□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 YGL177WYGL177W 348 nt3.11□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 PCL7YIL050W 858 nt3.11□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 GCD14YJL125C 1152 nt3.11□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 RPL17AYKL180W 555 nt3.11□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 MTR2YKL186C 555 nt3.11□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 RPS28BYLR264W 204 nt3.11□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 RHO5YNL180C 996 nt3.11□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 RRG9YNL213C 645 nt3.11□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 MCM16YPR046W 546 nt3.11□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 STE23YLR389C 3084 nt3.11□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 SPO71YDR104C 3738 nt3.1□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 UBP12YJL197W 3765 nt3.1□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 RDI1YDL135C 609 nt3.1□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 RPC11YDR045C 333 nt3.1□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 NKP1YDR383C 717 nt3.1□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 ERV29YGR284C 933 nt3.1□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 MBB1YJL199C 327 nt3.1□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 BOS1YLR078C 735 nt3.1□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 RNH203YLR154C 333 nt3.1□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 YBL065WYBL065W 345 nt3.1□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 YNL303WYNL303W 348 nt3.1□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 YOR114WYOR114W 885 nt3.1□□□□□ -1.91
VHS1Q03785 YOR186WYOR186W 435 nt3.1□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.8 ms