Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF2E1P29083 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms