Protein–RNA interactions for Protein: Q9HA90

EFCC1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCC1Q9HA90 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
EFCC1Q9HA90 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EFCC1Q9HA90 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EFCC1Q9HA90 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EFCC1Q9HA90 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EFCC1Q9HA90 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EFCC1Q9HA90 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EFCC1Q9HA90 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EFCC1Q9HA90 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EFCC1Q9HA90 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EFCC1Q9HA90 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EFCC1Q9HA90 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EFCC1Q9HA90 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EFCC1Q9HA90 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EFCC1Q9HA90 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EFCC1Q9HA90 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
EFCC1Q9HA90 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EFCC1Q9HA90 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EFCC1Q9HA90 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EFCC1Q9HA90 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms