Protein–RNA interactions for Protein: Q96LP6

C12orf42, Uncharacterized protein C12orf42, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf42Q96LP6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C12orf42Q96LP6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C12orf42Q96LP6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C12orf42Q96LP6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C12orf42Q96LP6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C12orf42Q96LP6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C12orf42Q96LP6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C12orf42Q96LP6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C12orf42Q96LP6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C12orf42Q96LP6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C12orf42Q96LP6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C12orf42Q96LP6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C12orf42Q96LP6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C12orf42Q96LP6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C12orf42Q96LP6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C12orf42Q96LP6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
C12orf42Q96LP6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
C12orf42Q96LP6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C12orf42Q96LP6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C12orf42Q96LP6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C12orf42Q96LP6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C12orf42Q96LP6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C12orf42Q96LP6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C12orf42Q96LP6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C12orf42Q96LP6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C12orf42Q96LP6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C12orf42Q96LP6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C12orf42Q96LP6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C12orf42Q96LP6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C12orf42Q96LP6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C12orf42Q96LP6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C12orf42Q96LP6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C12orf42Q96LP6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C12orf42Q96LP6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms