Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC36.45■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
TOPBP1Q92547 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TOPBP1Q92547 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
TOPBP1Q92547 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
TOPBP1Q92547 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
TOPBP1Q92547 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
TOPBP1Q92547 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
TOPBP1Q92547 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TOPBP1Q92547 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
TOPBP1Q92547 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TOPBP1Q92547 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
TOPBP1Q92547 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TOPBP1Q92547 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
TOPBP1Q92547 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
TOPBP1Q92547 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
TOPBP1Q92547 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
TOPBP1Q92547 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
TOPBP1Q92547 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
TOPBP1Q92547 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
TOPBP1Q92547 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
TOPBP1Q92547 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
TOPBP1Q92547 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
TOPBP1Q92547 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
TOPBP1Q92547 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
TOPBP1Q92547 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
TOPBP1Q92547 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
TOPBP1Q92547 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
TOPBP1Q92547 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
TOPBP1Q92547 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TOPBP1Q92547 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TOPBP1Q92547 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TOPBP1Q92547 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TOPBP1Q92547 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TOPBP1Q92547 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TOPBP1Q92547 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TOPBP1Q92547 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms