Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
LRRC9Q6ZRR7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
LRRC9Q6ZRR7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC33.07■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
LRRC9Q6ZRR7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms