Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COL24A1Q17RW2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
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