Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
GRIN2AQ12879 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC35.03■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
GRIN2AQ12879 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC35.01■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC34.99■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
GRIN2AQ12879 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
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