Protein–RNA interactions for Protein: Q12200

NCR1, NPC intracellular cholesterol transporter 1-related protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NCR1Q12200 NGG1YDR176W 2109 nt6.75□□□□□ -1.33
NCR1Q12200 MRPL9YGR220C 810 nt6.75□□□□□ -1.33
NCR1Q12200 YJL135WYJL135W 318 nt6.75□□□□□ -1.33
NCR1Q12200 RPS5YJR123W 678 nt6.75□□□□□ -1.33
NCR1Q12200 COF1YLL050C 432 nt6.75□□□□□ -1.33
NCR1Q12200 TPM1YNL079C 600 nt6.75□□□□□ -1.33
NCR1Q12200 NOP7YGR103W 1818 nt6.75□□□□□ -1.33
NCR1Q12200 ICL1YER065C 1674 nt6.74□□□□□ -1.33
NCR1Q12200 SSF2YDR312W 1362 nt6.74□□□□□ -1.33
NCR1Q12200 YFL051CYFL051C 483 nt6.74□□□□□ -1.33
NCR1Q12200 RAD6YGL058W 519 nt6.74□□□□□ -1.33
NCR1Q12200 FMC1YIL098C 468 nt6.74□□□□□ -1.33
NCR1Q12200 OPI8YKR035C 642 nt6.74□□□□□ -1.33
NCR1Q12200 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt6.74□□□□□ -1.33
NCR1Q12200 OST6YML019W 999 nt6.74□□□□□ -1.33
NCR1Q12200 ATP18YML081C-A 180 nt6.74□□□□□ -1.33
NCR1Q12200 VTI1YMR197C 654 nt6.74□□□□□ -1.33
NCR1Q12200 YPL107WYPL107W 747 nt6.74□□□□□ -1.33
NCR1Q12200 GLN1YPR035W 1113 nt6.74□□□□□ -1.33
NCR1Q12200 QCR2YPR191W 1107 nt6.74□□□□□ -1.33
NCR1Q12200 snR42snR42 351 nt6.74□□□□□ -1.33
NCR1Q12200 CCC2YDR270W 3015 nt6.74□□□□□ -1.33
NCR1Q12200 CAX4YGR036C 720 nt6.73□□□□□ -1.33
NCR1Q12200 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt6.73□□□□□ -1.33
NCR1Q12200 INA22YIR024C 651 nt6.73□□□□□ -1.33
NCR1Q12200 LCB3YJL134W 1230 nt6.73□□□□□ -1.33
NCR1Q12200 SHE2YKL130C 741 nt6.73□□□□□ -1.33
NCR1Q12200 RKI1YOR095C 777 nt6.73□□□□□ -1.33
NCR1Q12200 YRO2YBR054W 1035 nt6.73□□□□□ -1.33
NCR1Q12200 MNS1YJR131W 1650 nt6.73□□□□□ -1.33
NCR1Q12200 PAM1YDR251W 2493 nt6.73□□□□□ -1.33
NCR1Q12200 GCR2YNL199C 1605 nt6.72□□□□□ -1.33
NCR1Q12200 PEP7YDR323C 1548 nt6.72□□□□□ -1.33
NCR1Q12200 ENT2YLR206W 1842 nt6.72□□□□□ -1.33
NCR1Q12200 SIT4YDL047W 936 nt6.72□□□□□ -1.33
NCR1Q12200 YDR391CYDR391C 699 nt6.72□□□□□ -1.33
NCR1Q12200 YJL175WYJL175W 513 nt6.72□□□□□ -1.33
NCR1Q12200 YML047W-AYML047W-A 366 nt6.72□□□□□ -1.33
NCR1Q12200 COX5AYNL052W 462 nt6.72□□□□□ -1.33
NCR1Q12200 YBL083CYBL083C 426 nt6.72□□□□□ -1.33
NCR1Q12200 TIM18YOR297C 579 nt6.72□□□□□ -1.33
NCR1Q12200 YOR302WYOR302W 78 nt6.72□□□□□ -1.33
NCR1Q12200 YCT1YLL055W 1596 nt6.72□□□□□ -1.33
NCR1Q12200 ILV1YER086W 1731 nt6.72□□□□□ -1.33
NCR1Q12200 YPS6YIR039C 1614 nt6.72□□□□□ -1.33
NCR1Q12200 NEL1YHR035W 1893 nt6.71□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 ERC1YHR032W 1746 nt6.71□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 YDL009CYDL009C 324 nt6.71□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 SPO73YER046W 432 nt6.71□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 QCR10YHR001W-A 234 nt6.71□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 MRS1YIR021W 1092 nt6.71□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 FCF2YLR051C 654 nt6.71□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 YAR023CYAR023C 540 nt6.71□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 GRE2YOL151W 1029 nt6.71□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 AIM4YBR194W 372 nt6.71□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 RCM1YNL022C 1473 nt6.71□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 ECM3YOR092W 1842 nt6.71□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 CYC8YBR112C 2901 nt6.7□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 IRC10YOL015W 1761 nt6.7□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 SUF5tG(CCC)O 72 nt6.7□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 IDP2YLR174W 1239 nt6.7□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 YNL184CYNL184C 327 nt6.7□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 CHS5YLR330W 2016 nt6.7□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 PYK2YOR347C 1521 nt6.7□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 MUB1YMR100W 1863 nt6.69□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 RIX7YLL034C 2514 nt6.69□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 CDC34YDR054C 888 nt6.69□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 CAD1YDR423C 1230 nt6.69□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt6.69□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 ENP2YGR145W 2124 nt6.69□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 YAL037WYAL037W 804 nt6.69□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 YMR135W-AYMR135W-A 534 nt6.69□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 DCS2YOR173W 1062 nt6.69□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 ECM38YLR299W 1983 nt6.69□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 CDC55YGL190C 1581 nt6.69□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 VAN1YML115C 1608 nt6.68□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 FRE7YOL152W 1863 nt6.68□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 SCS2YER120W 735 nt6.68□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 YGR228WYGR228W 345 nt6.68□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt6.68□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 ERP1YAR002C-A 660 nt6.68□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 ARG80YMR042W 534 nt6.68□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 RPL3YOR063W 1164 nt6.68□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 YJR003CYJR003C 1560 nt6.68□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 ARG81YML099C 2643 nt6.68□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 QDR1YIL120W 1692 nt6.68□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 TKL2YBR117C 2046 nt6.67□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 TDA3YHR009C 1572 nt6.67□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 PBP4YDL053C 558 nt6.67□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt6.67□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 HYR1YIR037W 492 nt6.67□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 CHA4YLR098C 1947 nt6.66□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 YPL109CYPL109C 1974 nt6.66□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 BUD27YFL023W 2391 nt6.66□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 YJL119CYJL119C 324 nt6.66□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 TMA22YJR014W 597 nt6.66□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 TAL1YLR354C 1008 nt6.66□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 HXT3YDR345C 1704 nt6.66□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 NDT80YHR124W 1884 nt6.66□□□□□ -1.34
NCR1Q12200 HRP1YOL123W 1605 nt6.65□□□□□ -1.34
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