Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC4A3P48751 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A3P48751 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A3P48751 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A3P48751 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A3P48751 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A3P48751 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A3P48751 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A3P48751 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A3P48751 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A3P48751 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A3P48751 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A3P48751 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A3P48751 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A3P48751 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A3P48751 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A3P48751 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A3P48751 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A3P48751 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A3P48751 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A3P48751 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A3P48751 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC4A3P48751 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC4A3P48751 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC4A3P48751 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC4A3P48751 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC4A3P48751 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC4A3P48751 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC4A3P48751 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC4A3P48751 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC4A3P48751 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC4A3P48751 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC4A3P48751 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC4A3P48751 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC4A3P48751 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A3P48751 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A3P48751 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A3P48751 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A3P48751 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A3P48751 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A3P48751 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms