Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GTF2E1P29083 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF2E1P29083 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF2E1P29083 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms