Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms